Nathalie Becquart sinh năm 1969 ở Fontainebleau. Bà tốt nghiệp HEC Paris năm 1992, chuyên ngành kinh doanh. Bà tình nguyện ở Liban trong một năm rồi làm việc ở đó hai năm với tư cách là cố vấn trong lĩnh vực tiếp thị truyền thông.[1]

Năm 1995, Nathalie Becquart gia nhập Dòng Thánh Xaviê. Sau khi kết thúc việc học ở Marseille và trải qua hai năm tập sự, bà được gửi đi truyền giáo ba năm trong tổ chức Hướng đạo Pháp, phụ trách chương trình Plein Vent (hướng đạo trong các khu dân cư của tầng lớp lao động bình dân). Bà tiếp tục học thần học và triết học tại Trung tâm Sèvres (thuộc chủng viện Dòng Tên ở Paris) và đồng thời học môn Xã hội học tại École des hautes études en sciences sociales (Trường cao cấp xã hội học).[2] Sơ Nathalie Becquart còn học một khóa về thần học tại Boston College.[3]